產(chǎn)品名稱:sgRNA In Vitro one-step Transcription Kit
中文名稱:sgRNA體外一步轉(zhuǎn)錄試劑盒
產(chǎn)品編號與包裝規(guī)格:
編號 | 產(chǎn)品名稱 | 規(guī)格 | 產(chǎn)品介紹 | 價(jià)格 |
HKE369 | sgRNA In Vitro one-step Transcription Kit | 10次 | crispr基因編輯(一步法sgRNA 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒) | 1275 |
產(chǎn)品描述:
CRISPR/Cas9 是 一 種 來 源 于 細(xì) 菌 獲 得 性 免 疫 的 由 RNA 指 導(dǎo) Cas9 蛋 白 對 靶 向 基 因 進(jìn) 行 編 輯 的 技 術(shù) 。 CRISPR/Cas9 的切割是通過向?qū)?RNA(gRNA)與打靶基因組位置之間約 20bp 堿基的配對,且打靶序列的 3′端需要有 PAM 結(jié)構(gòu)(NGG),再引導(dǎo) Cas9 作用實(shí)現(xiàn)的。CRISPR/Cas9 與靶位點(diǎn)識別的特異性主要依賴于gRNA與靠近PAM 處 10~12 bp堿基的配對,而其余遠(yuǎn)離PAM 處8~10 bp 堿基的錯(cuò)配對靶位點(diǎn)的識別影響不明顯,這導(dǎo)致了CRISPR/Cas9 存在一定的脫靶性,可能發(fā)生非特異性切割,引起基因組非靶向位點(diǎn)的突變,這樣會造成研究結(jié)果的不確定性以及 研究工作量的大量增加。環(huán)凱生物CRISPR/Cas9 基因編輯系統(tǒng)能有效解決這一問題。
sgRNA In Vitro one-step Transcription Kit(一步法sgRNA 體外轉(zhuǎn)錄試劑盒)能夠一步法體外高效轉(zhuǎn)錄不同的 sgRNA 片段,進(jìn)一步通過 sgRNA 體外篩選及基因型鑒定試劑盒(Cat.No:HKE370)篩選出脫靶率低的 sgRNA,用 于后續(xù)科研實(shí)驗(yàn)。
產(chǎn)品特點(diǎn):
一步法高效轉(zhuǎn)錄不同的 sgRNA 片段,操作簡單快捷;
sgRNA 產(chǎn)量可達(dá) 10-30μg。
保存條件:-20℃保存,或-80℃長期保存。
sgRNA In Vitro one-step Transcription Kit 產(chǎn)品組成:
產(chǎn)品組成 | 體積 |
2×sgRNA Reaction Buffer | 150 μL |
Enzyme Mix | 20 μL |
DNase I(2U/μL) | 10 μL |
RNase Free Water | 1 mL |
流程模式:
操作步驟:
I,sgRNA 模板擴(kuò)增
擴(kuò)增引物設(shè)計(jì)(選取Target DNA序列PAM(NGG)的5'端20 bp 進(jìn)行正向(F)引物設(shè)計(jì),引物結(jié)構(gòu)包含T7 promoter(20 bp)、Target DNA 片 段(20 bp)和實(shí)際與反向引物結(jié)合的片段(21 bp)。引物設(shè)計(jì)如下:)
II,sgRNA 體外轉(zhuǎn)錄體系
依次加入以下反應(yīng)組分配制轉(zhuǎn)錄體系:
2×sgRNA Reaction Buffer | 10 μL |
正向引物(10 μM) | 2 μL |
Enzyme Mix | 2 μL |
RNase Free Water | To 20 μl |
37 ℃保溫 1 h、70℃保溫 10 min
注: 轉(zhuǎn)錄時(shí)間0.5-2 h 即可,如需得到更多 sgRNA,可適當(dāng)延長至 3 h。
III,sgRNA 純化
模板 DNA 的去除:向轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中加 1μL DNase Ⅰ,37°C 反應(yīng)10 min,以去除 DNA 模板,將反應(yīng)產(chǎn)物放入 75℃反應(yīng) 10 min, 得到 的 sgRNA 置于-20℃保存。sgRNA 可直接用于切割,如需純化,可選擇以下 sgRNA 純化步驟,但 sgRNA 會有所 損失。
sgRNA 純化(可選):
1. 轉(zhuǎn)錄體系 20 μL 用 RNase Free Water補(bǔ)至 300 μL,加入等體積酚?氯仿?異戊醇(25:24:1),充分混合后, 12000 rpm,4°C 離心 15 min。
2. 取上清,加入 300μ L 氯仿,充分混勻后,12000r pm,4℃離心 5 min。
3. 取上清約 200 μL,為提高回收量,下層可再加入 100 μL RNase Free Water,充分混合后,4℃離心 5 min, 取上清。
4. 將兩次取的上清合并,總體積約 300~350 μL,加入 2 倍體積的異丙醇和 1/10 體積的用 RNase Free Water 配置的 3M NaAc,-80°C 沉淀過夜。
5. 離心取沉淀,加入 1 mL RNase Free Water配制的 75%乙醇,洗滌兩次。
6. 用 20 μL RNase Free Water溶解 RNA,電泳檢測質(zhì)量并進(jìn)行濃度測定。
應(yīng)用實(shí)例:
圖例一:使用一步法sgRNA 體外轉(zhuǎn)錄 試劑盒轉(zhuǎn)錄sgRNA,大小為97 nt。
泳道1:DL2000;
泳道 2、3、4:sgRNA
圖例二:將轉(zhuǎn)錄出的sgRNA 做體外 切割檢測。
泳道 1:DL2000;
泳道 2 、3 : sgRNA 切割后條帶 1500bp、1000bp、500bp